就读于月海原学园的岸波白野，他的日常生活被分身们破坏了。白野重新唤回了自己的使役者──术士，和过去的对手们一起攻略引发异变的元凶──樱之迷宫。另一个「Fate/EXTRACCC」，已知却未知的故事即将开始——
为了逃离月球背面，岸波白野和术士闯入了樱之迷宫。而挡在他们面前的是主人．坂神一人以及身份不明的使役者．剑兵。另一边，留在校舍里的保健室成员们遭受了袭击，高文和迦尔纳挺身而出，面对新出现的分身．芭修莉普及梅尔特莉莉丝。两边的战场分别展开壮烈的战斗，最后能存活下来的是──
巨大的分身──金布罗堤雅现身挡在打算脱离樱之迷宫的白野和术士面前。白野带着「爱」面对这有着压倒性强大的对手，然而……已知却又未知的「Fate/EXTRACCC」，故事急速进展的第三集！
温泉突然出现在樱之迷宫内，术士与谜样的剑兵在那里再度相遇。在那里现身的剑兵的真实身分究竟是？而ＢＢ那一方也发生了异常变化!?已知却又未知的「Fate/EXTRACCC」，淫乱又盛大的第四集！
莳奈子和慎二得知了自己的过去，打算背叛学生会。他们的使役者──迦尔纳及分身──拜欧蕾袭向术士等人！！已知却又未知的「Fate/EXTRACCC」第五集！
间桐慎二想起了自己与岸波白野过去的种种，和分身──拜欧蕾一起袭向术士和岸波白野。在两位使役者的战斗愈发白热化之际，铃鹿御前盯上了孤立无援的岸波白野……
术士因为铃鹿御前的奸计倒下。李奥与慎二为了拯救孤立的岸波白野而赶来，BB却挡在了两人面前。已知却又未知的「Fate/EXTRACCC」故事终于到达隐藏在黑暗中的真实──！！
为了拯救和术士狐分开的白野，金格普萝缇雅出现了。以虫空间为舞台，两名分身开始了冲突！另一方面，术士狐看着某个魔术师的梦──已知却又未知的「Fate/EXTRACCC」Alterstory。
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