时间是U.C.0092――居住在「被人遗忘的殖民卫星」双月的光族少年尤塔，目击了漂流到殖民卫星的MS残骸，这将掀起大时代的浪潮……！？
在双月的危机中，少年尤塔与友人触犯禁忌飞向宇宙，而此时吉翁与联邦的战争也正如火如荼的展开中！由福井晴敏撰写的新人类史诗新篇章，剧情激荡的第二集登场！
背负月亮的巨人――MOON钢弹觉醒的时刻降临！！
宇宙世纪0092──「被遗忘的殖民卫星」双月遭到了不明MS的头部撞击发生故障，尤塔．卡西姆等人为了求助而前往卫星外头的世界，不慎与新吉翁军方接触，使得双月不只遭受联邦军追击，还卷入新吉翁的内部派系斗争。就在此时，有谜样MS好似感应到尤塔内心的悲愤而启动。该机体运用状似新月的武器，击破了进攻殖民卫星的敌人，其样貌恰似在诸多战乱中留下传奇性活跃的「钢弹」。无关乎新吉翁公主的地位，曾与尤塔短暂交心的少女米妮瓦．萨比落入了联邦手里。此刻，联邦与新吉翁的援军正朝双月逼近，着迷于钢弹之力的尤塔，今后该走向哪条路途──
为了拯救被拉．奇尔斯囚禁的米妮瓦，琉斯少校要求双月合作出借MOON钢弹与战士队。尤塔在琉斯的安排下，驾驶MOON钢弹初上战场，但却遇到对新人类满怀恨意的伍鲍德上尉……
为了拯救被联邦囚禁的米妮瓦，杰纳罗以G3毒气威胁拉．奇尔斯全舰，不料遇到前来救援的阿姆罗。欠缺战场经验的尤塔即将驾驶MOON钢弹与王牌驾驶员阿姆罗对决……？
尤塔与阿姆罗联手击退了琉斯，如此认为的众人却惊见吉翁的超巨大战舰「格瓦沙」现身！由福井晴敏所描绘的全新宇宙世纪神话，故事迈入第三章，尤塔将与米妮瓦启程前往地球——！
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